Nemocničná lekáreň (NL) poskytuje špecializovanú lekárenskú starostlivosť pre hospitalizovaných pacientov a komplexné liekové poradenstvo pre zdravotníckych pracovníkov ústavu. Od roku 2018 je NL zaradená medzi výučbové lekárne Slovenskej lekárnickej komory a zabezpečuje odbornú prax študentom farmaceutických fakúlt.
Nemocničná lekáreň NÚSCH, a.s. pozostáva z troch oddelení: Oddelenie klinickej farmácie, Oddelenie prípravy humánnych liekov a Oddelenie zdravotníckych pomôcok.
