Oddelenie centrálnej sterilizácie (OCS) má na starosti prípravu sterilných zdravotníckych pomôcok, dezinfikovanie zdravotníckych pomôcok opakovane používaných v liečebno-preventívnej starostlivosti pre všetky zložky nemocnice, tak aby ich ďalšie použitie neohrozilo priamo alebo nepriamo klinický stav a bezpečnosť pacienta a zdravie užívateľa. OCS je členené na Úsek sterilizácie a Úsek kontroly.